PCR继续应用于世界各地新出现的威胁。针对COVID-19的聚合酶链反应测试是一种分子测试，用于分析患者的上呼吸道标本，寻找导致COVID-19的病*SARS-CoV-2的RNA。科学家使用该技术将测试样本中的少量RNA扩增为DNA，这些DNA被复制直到SARS-CoV-2被检测到-如果它存在，那就是。PCR检测被称为诊断COVID-19的*金标准检测，并于年2月首次获准在美国使用。
PCR也被应用于检测食源性病原体的测试。年首次开发出一种分子检测卡耶塔尼氏环孢子虫的方法，该方法与食用受污染的绿色蔬菜引起的疾病有关，但由于缺乏敏感性，其使用存在问题，方法不允许区分不同物种，并且缺乏商业上可用的供应。最近，美国食品和药物管理局的科学家开发并验证了一种更好的方法来回收和鉴定卡伊塔尼西猪笼草，使用PCR洗涤产物，从洗涤中提取DNA，并使用PCR扩增来发现“坏”的东西。该测试可用于香菜，胡萝卜丝，生菜，罗勒等。
今天，PCR在下一代测序等技术中发挥着越来越重要的作用，在未来的分子诊断技术中也非常重要。从PCR发展而来的最新技术包括数字PCR，基于液滴的数字PCR，基于芯片的数字PCR和等温扩增方法。PCR目前用于病例诊断检测，用于在美国邮局进行样本到答案操作，以诊断炭疽杆菌，并在南非进行HIV和结核病检测。
现如今市场对PCR所使用的耗材越来越严格，对耗材的需求也越来越大，而在PCR检测中所使用到的主要耗材就是PCR板，这个时候作为辅助又必不可少的PCR封板膜就相当于PCR板的一个“瓶盖”，防止空气中杂质的污染、蒸发，而PCR封板膜也分为不同的材质：透明聚酯纤维膜、压敏封板膜、专业qPCR封板膜、专业qPCR封板膜（大面积）